Während sich im Endspiel nun zwei Vereine der bayerischen Amateur-Spitzenliga gegenüberstehen, mussten die favorisierten Drittligisten im Verlauf des Pokal-Wettbewerbs die Segel streichen. Jahn Regensburg unterlag in der 2. BFV-Hauptrunde sensationell dem Halbfinalisten Sportfreunde Dinkelsbühl (3:4) und die SpVgg Unterhaching verlor das Viertelfinale gegen Ligakonkurrent Wacker Burghausen (0:1). Für Burghausen war dann im Halbfinale beim SV Schalding-Heining Endstation (0:1).
Das Toto-Pokal-Finale zwischen Gastgeber SV Schalding-Heining und dem FC Würzburger Kickers findet am Dienstag, den 13. Mai um 18.30 Uhr statt. Der Toto-Pokal-Sieger erhält 5000 Euro und qualifiziert sich für die 1. Hauptrunde im DFB-Pokal, verbunden mit Fernseheinnahmen von rund 100.000 Euro und der Chance auf ein Spiel gegen einen hochkarätigen Bundesligisten.